何謂巢箱
在認識巢箱研究前，先介紹人工巢箱（artificial nest box）或簡稱巢箱（nest box），人工巢箱即由利用木材製作供動物棲息或繁殖使用的木箱，除具有巢洞開孔可供動物進出，也設計了可掀開的頂蓋或是側板（圖1），以便研究人員觀察記錄，因此也可利用廢棄木材加以回收加工利用，可供利用次級樹洞的物種使用，其中大多為鳥類，如：山雀類或鴟鴞科（貓頭鷹）鳥類，這些鳥種不像啄木鳥與五色鳥等鳥類會自行挖洞，故利用天然形成之樹洞或是別種鳥類挖出的樹洞。
實際上，在決定使用巢箱進行監測前，也要先評估放至巢箱之地點是否適合，因放置巢箱的目的之一為補償作用，因此多設置於缺乏天然樹洞的人工林（如：台灣山區的人工針葉林）中，或是受人為干擾後，無足夠大樹提供樹洞的次生林中，如此巢箱設置後才有較佳的成果；而設置巢箱的另一目的則為增加調查繁殖資料之便利性，因天然巢位不易尋找，且難以長期且有效的監測，所以利用固定位置的巢箱，易於進行長期監測，且可再於巢箱內架設針孔攝影機或麥克風，進行錄影與錄音，可獲得更詳細的繁殖資料，進行更深入的分析研究，另外，也有研究者在巢箱外架設數位紅外線自動照相機，可全日監測使用巢箱之物種，且可由攝影而得知動物於巢箱附近的活動狀況，而易於得知所有可能使用巢箱的物種。
雖說架設巢箱的好處很多，但也可能有一些壞處，如：人工巢箱與天然樹洞相較之下，人工巢箱之外觀輪廓較為明顯，有可能較易吸引掠食者靠近，另外，也有可能遭有心人士蓄意干擾或破壞，反而造成了反效果，因此當巢箱樣區位於遊憩區或是城市郊區等人群易於到達之處時，同時也要考慮人為干擾可能對巢箱所產生的影響，讓大家對於巢箱的保護以及其重要性有共識，才能使讓巢箱發揮其效益。
觀霧的鳥類巢箱調查
98年度（2009）為設置巢箱的第一年，因此從巢箱的設計、製作到設置皆須由我們一手包辦，而本次監測的目標物種為小型鳥類，因此設計上主要沿用先前太魯閣國家公園關原地區之巢箱樣式，製作洞口大小為直徑3公分，底部大小為13公分見方的巢箱（圖2），然後為每一個巢箱編號以利辨識，另外，選擇巢箱樣區時須顧慮地形與腹地，地形若過於陡峭，則會降低巡巢的方便性與安全性，而腹地大小要足夠架設一定數量的巢箱（如：30個），因此，我們將巢箱以固定距離（15至20公尺）之矩陣排列（圖3），使巢箱之間不至於過度擁擠，且方便研究人員依巢箱設置順序巡巢，也可減少人為偏好對於巢樹選擇的影響，以達到隨機選擇巢樹之目的，最後我們選了三個樣區放置巢箱，其中有兩個樣區位於觀霧地區的瀑布步道周邊（之後簡稱瀑布區），而在瀑布區巢箱中有些與步道的距離少於十公尺，可做為未來解說教育與推廣保育之用。
我們進行巢箱監測調查的方式為，定期巡視巢箱觀察與紀錄其內部變化，並拍照留存，巡巢頻度為非繁殖季每月一次，若是繁殖季則增為每月兩次，如此可得知各個巢箱月份間被使用的變化模式；另在巡巢過程中，較麻煩的是要背著三公尺長的鋁梯在樹林間穿梭，而除少數濃密單調的人工針葉林其地表少有其他植被外，大多數針葉樹之間的地表均有許多灌叢覆蓋，因而造成研究人員的阻礙，但習慣後就可利用鋁梯的優勢，借力使力，排除灌叢與雜草的阻擋。
此外，每次巡巢的心情也都會受到巢箱狀況的影響，每當巢箱內新增巢材或有任何新的進展，都會振奮人心，讓興奮蓋過巡巢的辛勞，但若是巢箱內無任何改變時，就也顯得失望乏力，覺得我們設置了這麼棒的家，怎麼會沒有鳥類要利用呢？此外，也正思考怎樣的巢位鳥類才會使用，以及有哪些微棲地的因子影響了鳥類對巢位的選擇，這些問題值得我們好好地深入研究。
觀霧巢箱繁殖成果
經由本年度的調查，我們發現兩種鳥類使用巢箱繁殖，分別為青背山雀與棕面鶯，而有繁殖紀錄（指有下蛋）的巢箱共有17個，占全部巢箱（90個）的18.89％，其中5個為青背山雀，12個為棕面鶯，以棕面鶯為主要使用鳥種。然而根據今年鳥類資源調查顯示，巢箱樣區中尚有其他可能使用巢箱的鳥種活動，如：茶腹鳾，卻無使用巢箱之現象，這是往後的巢箱監測值得注意之處。
由於青背山雀與棕面鶯皆為晚熟性鳥類，所以雛鳥孵出時眼睛是緊閉的 （圖4、圖5）
要等數天之後眼睛才會睜開，因此如果巡巢的時間點剛好的話，即可幸運地在同一巢中，看到雛鳥眼睛緊閉與睜開的狀態（圖6、圖7）
根據觀察結果，發現青背山雀與棕面鶯使用的巢材類型是完全不同的，青背山雀主要以松蘿這種地衣做為主要巢材，並以棉絮類物質做為內襯（圖8、圖9）
而棕面鶯則以闊葉樹之樹葉與竹葉做為主要巢材，再以苔蘚類的蒴柄做為內襯（圖10、圖11）
因此於巡巢期間，在尚未發現蛋或是雛鳥之前，都以巢材種類區分使用的鳥種差異。另外，在本年度的所有巡巢紀錄中，當巡視有繁殖的巢位時，從未發現棕面鶯親鳥留在巢中，但卻有多次紀錄發現青背山雀親鳥留在巢中孵蛋或是孵雛，唯因本年度資料不足，無法再做更詳細之分析，但對於棕面鶯是否對於環境變化較為敏感，或是受人為干擾（如：巡巢、架梯子等）之影響較大等問題，是值得討論深思的。
結語
由本年的資料，只能了解今年鳥類繁殖的狀況，無法對未來做任何推測評估，因此持續進行巢箱監測是必要的，此外，由於本年度調查中曾發現鳥類以外的動物使用巢箱（圖12、圖13）
不知是否有其他動物（如條紋松鼠、小鼯鼠等）可能利用巢箱，且我們僅有基本資料的收集，往後對於巢箱被動物使用情形可藉由其他器材之輔助而更深入了解，如：架設巢內的針孔攝影機監測鳥類繁殖，或是在巢外架設紅外線自動相機，可了解有哪些動物對巢箱有興趣，這些結果應會相當有趣且令人期待。